系統樹とブートストラップ値

前に帰無仮説についてエントリーを挙げたのですが、
今日は系統樹とブートストラップ値について。

ここ近年の分子生物の著しい発達で、
生物の系統間の分岐、進化が明らかになってきています。

アミノ酸のランダムな変化は時間にほぼ比例して起こると考えられており，距離は比較している生物が分化してからの時間に比例していると仮定して系統樹を作ります。
最も簡単に距離を求めるには，まず配列間でアミノ酸が異なる個数を数え、近縁なものから順々のつなげます。

たとえば、
ヒトとアカゲザルとウマ、ニワトリ、マグロなどの種から相同たんぱく質のアミノ酸配列を並べ、
種類によっての違いを調べます。
ヒトーアカゲザル、、、１
ヒトーウマ、、、、１２
ヒトーニワトリ、、、１３
ヒトーマグロ、、、２１
と、いうように、今度はアカゲザルとウマ、、、などなどを調べます。
そして、その違いから系統間の分岐を推測していきます。

こうしてでき上がるのが、いわゆる「系統樹」です。

さて、この系統樹の確からしさを検証する方法の一つがブートストラップ値です。
統計学の手法の一つです。
すごく面倒くさいので、興味のある方は先のサイトをご覧ください。
詳しく説明が載っています。

帰無仮説の時も思ったのですが、
科学は結論を出すことに謙虚です。
決して「○○は□だ」と簡単には表しません。
それは、あるときは歯がゆいくらい回りくどいのですが、
それでも、
□が１つとは限らないかもしれないなら、あらゆる可能性に対して調べること、研究することは大切です。
「今の段階では□」と言うことです。
科学という言葉を聞いただけで、
教条的な融通のきかないものを連想されることがあったとしたら、
それは、科学というものの柔軟さや謙虚さを知らないものだと考えます。
実際、科学に携わっている方々は「ことの本質が膨大であること」を実感として感じています。
けっして、断定や決めつけはいたしません。

まだまだ私たちの世界は知らないことだらけ。
未開です。
未開の分野を開拓するにあたり、
人は、万全の準備と計画と結論への推測をもってして望みます。
本当にワクワクする世界です。
そして、そんな世界は、べつに科学だけのものではありません。
私たちの日常がまさにそうです。
知っているつもり、理解しているつもりだったが、実はまだまだ知らないことだらけです。
それは人間関係だったそうです。
夫や子ども、近所の方々、ネットの友人たち。
だからこそ、
一日、いちにちの潤いがあろうというもの。

と、言うことで、
今日は系統樹作成に頭を悩ましながらふと思ったことをツラツラと。